El origen de las colecciones del Museo Regional de Aysén responde mayoritariamente a la gestión de la propia Institución. No existe una entidad antecesora que haya legado una colección que organice el quehacer institucional del área de colecciones.
Actualmente, la colección del Museo Regional de Aysén se compone de piezas relevantes para la comprensión del territorio, la historia e identidad de la región de Aysén y sus habitantes. Estas abarcan áreas como la geología, paleontología, ciencias naturales, prehistoria, la historia y arte, representada por objetos culturales y manifestaciones del patrimonio inmaterial.
En el ámbito de la cultura, son importantes aquellos objetos que forman y han formado parte de la vida cotidiana, informando de los modos de vida que los habitantes de una zona geográfica determinada dentro del gran territorio de Aysén.
Al tratarse el Museo Regional de Aysén de una institución joven, es parte de su misión ampliar sus colecciones, según lo indica su Política de Colecciones. Desde el año 2023, cuenta con un depósito refaccionado que permite proyectar su crecimiento.
Cabe destacar que el Museo Regional de Aysén podrá aceptar colecciones que no provengan necesariamente de los límites actuales de la Región de Aysén. Se ha planteado Patagonia como marco de acción, pensándolo como un territorio que aporta a la mejor comprensión e implementación de la misión establecida.
Correo electrónico: colecciones.muray@museoschile.gob.cl